Вопрос не правильно ставится. В данном случае вопрос надо ставить так - а откуда известно, что организации разные и мы доверяем им в том, что они реально разные.

Согласен. Пока что похоже, что все ноды блокчейна ЭГ (электронного голосования) находятся под контролем ДИТ (Депаратамента Информационных Технологий) города Москвы.

кто создаёт ключи, которыми шифруется/подписывается то, как проголосовал пользователь. Если это не пользователь - то что мешает создавшему переголосовать за пользователя ещё раз?

К сожалению я ничего не знаю об использовании ключей. Надо будет ознакомиться.

где прозрачность процесса попадания результатов голосования в блокчейн? он на то и должен быть распределённым (и хранится во многих местах), чтобы при расхождениях - определять - что вот этому мы доверять не будем, он не кошерный.

Это претензия вроде бы эквивалентна самой первой: что весь блокчейн ЭГ находится по контролем одной организации и посторонние не могут подключиться к нодам этого блокчейна, чтобы его проконтролировать его целостность.