А затем что шарик долго не поциркулирует. Водород, а особенно, гелий - штука которая способна просачиваться сквозь что угодно.
Поэтому срок жизни шарика в верхних слоях атмосферы каньона будет составлять в лучшем случае недели.

Значит эти тысячи шариков придется регулярно заменять. И собирать выпавшие на головы людям. Хотя, возможно, в нижних слоях атмосферы циркулящция воздуха будет сносить потерявшие подъемную силу шарики куда-то в осмысленные места, где их будет можно легко собрать на переработку.